More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0985 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
501 aa  1004    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.3 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000774883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 
520 aa  349  8e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0553  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.33 
 
 
494 aa  326  6e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00432944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  30.1 
 
 
518 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 
520 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 
534 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 
529 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 
530 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 
532 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.75 
 
 
529 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 
543 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 
529 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 
539 aa  203  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
510 aa  203  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.7 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.7 
 
 
526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 
518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 
537 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 
537 aa  200  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
524 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.39 
 
 
515 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 
577 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.04 
 
 
522 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 
515 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.94 
 
 
520 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  28.33 
 
 
511 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 
515 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 
526 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 
511 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.67 
 
 
525 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 
537 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 
529 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 
527 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 
531 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 
511 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.9 
 
 
523 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 
543 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 
511 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 
511 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 
511 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
532 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  29.56 
 
 
511 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  29.56 
 
 
511 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 
537 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.73 
 
 
519 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 
508 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 
530 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  29.13 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 
521 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.16 
 
 
520 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 
539 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
519 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 
520 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 
506 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.26 
 
 
531 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
519 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 
526 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
519 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29 
 
 
509 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
531 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.95 
 
 
534 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 
505 aa  189  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 
512 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 
527 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 
509 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
511 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 
505 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.41 
 
 
524 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
517 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 
512 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 
520 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 
512 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  28.31 
 
 
512 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 
528 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.89 
 
 
544 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 
527 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 
635 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  28.31 
 
 
512 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.86 
 
 
561 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
531 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
531 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
531 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 
519 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 
561 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 
520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 
523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 
520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
526 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>