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for query gene Rfer_0907 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 496 aa  986    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  65.29 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.35 
 
 		 497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.7 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  64.38 
 
 		 498 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.84 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
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NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.63 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.82 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
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NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  49.28 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.25 
 
 		 543 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.87 
 
 		 539 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.5 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 537 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 529 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 521 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  30.33 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.96 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 521 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 561 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.1 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.94 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.22 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.62 
 
 		 501 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.41 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.35 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.03 
 
 		 529 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.32 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.13 
 
 		 599 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.13 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 599 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  27.91 
 
 		 599 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 599 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 599 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.91 
 
 		 599 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  27.91 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.84 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.32 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.48 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 		 528 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.6 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.54 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.6 
 
 		 513 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.4 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  25.76 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.24 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.73 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 524 aa  156  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 		 494 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 523 aa  156  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.39 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.68 
 
 		 512 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.28 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.95 
 
 		 537 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.19 
 
 		 537 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.89 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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