More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5562 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.52 
 
 		 497 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  76.36 
 
 		 498 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  100 
 
 		 502 aa  981    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.29 
 
 		 496 aa  621  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.91 
 
 		 482 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.32 
 
 		 485 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.12 
 
 		 485 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.73 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  53.85 
 
 		 487 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.32 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.14 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 523 aa  316  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 		 531 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.37 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.51 
 
 		 537 aa  286  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  27.58 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 501 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 529 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 579 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.36 
 
 		 484 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.44 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  27.04 
 
 		 599 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 		 599 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.04 
 
 		 599 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 599 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.04 
 
 		 599 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.11 
 
 		 599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.1 
 
 		 515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 		 570 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 		 635 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 496 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 		 526 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 539 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.62 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.2 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.57 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.35 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.85 
 
 		 445 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.05 
 
 		 513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  26.16 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 517 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 537 aa  156  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 528 aa  156  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.78 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.78 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.75 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.52 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.94 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 657 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  27.41 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 		 517 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
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NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.04 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.9 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.17 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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