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for query gene Reut_A3247 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79 
 
 
508 aa  767    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
511 aa  1019    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  84 
 
 
512 aa  826    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.96 
 
 
512 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.76 
 
 
509 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  83.01 
 
 
534 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.81 
 
 
532 aa  854    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.09 
 
 
512 aa  794    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.39 
 
 
493 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  60 
 
 
514 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.3 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  58.3 
 
 
514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.78 
 
 
513 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.27 
 
 
507 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  54.64 
 
 
507 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.64 
 
 
507 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.51 
 
 
508 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.69 
 
 
511 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
511 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.58 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.17 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.17 
 
 
526 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.49 
 
 
513 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.94 
 
 
520 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.5 
 
 
513 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.8 
 
 
513 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.6 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.43 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.51 
 
 
520 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
524 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.25 
 
 
518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
529 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.18 
 
 
517 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.06 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 
515 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.73 
 
 
511 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  40.73 
 
 
561 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.25 
 
 
515 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 
537 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.11 
 
 
521 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.86 
 
 
500 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 
530 aa  359  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
520 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 
532 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.17 
 
 
517 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 
517 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.9 
 
 
514 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.04 
 
 
503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 
510 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.92 
 
 
526 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  36.94 
 
 
526 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.54 
 
 
519 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 
525 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.31 
 
 
526 aa  325  2e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.33 
 
 
532 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.37 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 
530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.37 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  36.34 
 
 
496 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 
506 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
534 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
534 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 
530 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 
530 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 
511 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  35.52 
 
 
495 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 
511 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 
539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.99 
 
 
539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 
539 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.97 
 
 
529 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  35.04 
 
 
518 aa  309  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 
520 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 
522 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 
520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 
520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 
515 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
520 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
520 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 
520 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
520 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  38.7 
 
 
511 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.6 
 
 
539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 
539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.6 
 
 
539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  38.02 
 
 
512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 
520 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 
520 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.6 
 
 
539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  38.7 
 
 
511 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.7 
 
 
511 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  38.02 
 
 
512 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.26 
 
 
520 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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