More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2012 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  95.88 
 
 		 413 aa  765    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  822    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  69.76 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  67.74 
 
 		 416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 418 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  32.03 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.77 
 
 		 457 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30.64 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 461 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.91 
 
 		 475 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 461 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.71 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 542 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 578 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.14 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>