More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3989 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
426 aa  815    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  98.12 
 
 
426 aa  805    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  99.3 
 
 
426 aa  811    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
413 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
413 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  44.2 
 
 
413 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  42.55 
 
 
416 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  35.24 
 
 
418 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  35.6 
 
 
405 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.43 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.03 
 
 
430 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  33.24 
 
 
447 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.51 
 
 
405 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.85 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  33.6 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  32.38 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.68 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  32.89 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.58 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  32.11 
 
 
457 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30 
 
 
472 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.6 
 
 
444 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  31.59 
 
 
424 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.5 
 
 
437 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.77 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.01 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  30.59 
 
 
465 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.27 
 
 
467 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  31.78 
 
 
470 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.27 
 
 
467 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.71 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.28 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  31.31 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.71 
 
 
468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  31.05 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.88 
 
 
442 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.26 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.21 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.67 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.55 
 
 
464 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.42 
 
 
418 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.64 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.09 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  31.56 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  28.72 
 
 
437 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.47 
 
 
442 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.99 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.24 
 
 
438 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.42 
 
 
450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.81 
 
 
443 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.95 
 
 
441 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  30.3 
 
 
471 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.88 
 
 
457 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.52 
 
 
451 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.13 
 
 
441 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  28.46 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.65 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  30.03 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.03 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  34.67 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  30.67 
 
 
440 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  28.86 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  28.39 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.01 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  34.6 
 
 
450 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.25 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  36.92 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  28.57 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30 
 
 
438 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.67 
 
 
464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.75 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  30.37 
 
 
442 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  30.37 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.07 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  30.59 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  29.16 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  29.16 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.03 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
440 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.4 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  35.11 
 
 
536 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.43 
 
 
447 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.66 
 
 
451 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
449 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42838  MFS family transporter  27.75 
 
 
472 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183784  normal  0.513972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
449 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  38.27 
 
 
578 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>