More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1735 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  74.49 
 
 		 440 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  863    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  61.34 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  56.48 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  59.02 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  59.52 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  57.51 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.65 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.56 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 435 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 454 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 439 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  28 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.77 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 451 aa  90.9  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 418 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  24.54 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.91 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.56 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  28.2 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.24 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  27.24 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.73 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 578 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.44 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>