More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7178 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  69.28 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  69.28 
 
 		 441 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  69.28 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  69.98 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  69.28 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  69.28 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  66.28 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  65.99 
 
 		 442 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 442 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  66.44 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  61.34 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  61.67 
 
 		 440 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 426 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  56.94 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 434 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 413 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 405 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.87 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 506 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 437 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.27 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 442 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  26.84 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 439 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  22.71 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  22.71 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  22.71 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>