More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3438 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  100 
 
 
506 aa  1012    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  42.96 
 
 
430 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  43.81 
 
 
441 aa  289  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  43.47 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  40.15 
 
 
433 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  40.22 
 
 
453 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  39.65 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  38.57 
 
 
438 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  36.07 
 
 
438 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  40.26 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  40.9 
 
 
449 aa  236  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.3 
 
 
418 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  36.25 
 
 
448 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  36.75 
 
 
438 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  34.64 
 
 
442 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  35.24 
 
 
461 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
440 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  47.85 
 
 
578 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  31.99 
 
 
472 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.3 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.73 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.73 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  32.04 
 
 
530 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.12 
 
 
475 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.28 
 
 
426 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.38 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.67 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.12 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  28.44 
 
 
467 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.44 
 
 
470 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  29.19 
 
 
465 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  28.94 
 
 
465 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  45.81 
 
 
542 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.88 
 
 
433 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.11 
 
 
424 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  35.32 
 
 
442 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.61 
 
 
440 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.13 
 
 
424 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
435 aa  159  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.25 
 
 
450 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
471 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.34 
 
 
426 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.04 
 
 
461 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.01 
 
 
437 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.87 
 
 
449 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
426 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  29.72 
 
 
450 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
413 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  43 
 
 
536 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
426 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
471 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  33.14 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  29.84 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  32.42 
 
 
479 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.24 
 
 
441 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.18 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.85 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.24 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  30.46 
 
 
443 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  29.47 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  31.32 
 
 
432 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.32 
 
 
405 aa  130  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.16 
 
 
440 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.45 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.54 
 
 
461 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.76 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
198 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  28.09 
 
 
464 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
405 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.66 
 
 
461 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.59 
 
 
440 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.31 
 
 
490 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  37.69 
 
 
533 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.88 
 
 
418 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.93 
 
 
416 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.29 
 
 
416 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  27.89 
 
 
443 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  24.88 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.09 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  27.36 
 
 
441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
850 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.12 
 
 
457 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  26.38 
 
 
420 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  25.82 
 
 
453 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.75 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.23 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.24 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  26.89 
 
 
452 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.95 
 
 
426 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.94 
 
 
427 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.38 
 
 
441 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.37 
 
 
426 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
449 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>