More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3842 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  848    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  60.36 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  55.91 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 850 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 442 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 506 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  26.58 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  25.32 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.96 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 450 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 542 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.49 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.78 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.27 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.55 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.42 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 465 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.42 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  25.37 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  25.37 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 470 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  26.92 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  27.05 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.39 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  24.18 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43382  predicted protein  26 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>