More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0609 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  100 
 
 		 472 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  56.49 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  42.95 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  42.95 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  38 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 461 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 450 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.26 
 
 		 475 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 490 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 471 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  30 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 578 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 530 aa  133  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  31.7 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  34 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.1 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 413 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 450 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.15 
 
 		 479 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.28 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 198 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 420 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>