More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3192 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  872    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  77.73 
 
 		 449 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  80.51 
 
 		 450 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  77.98 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  76.87 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  32.83 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  32.83 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 413 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 441 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 467 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 433 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.85 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 578 aa  136  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 542 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 530 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 438 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.65 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  28.97 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  28.97 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  28.62 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>