More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0816 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  100 
 
 		 536 aa  1041    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  58.69 
 
 		 530 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 542 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 		 440 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 461 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 465 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  39.92 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.57 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  44.95 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  44.95 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 450 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 454 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 440 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 440 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 454 aa  127  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 457 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 442 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  40.09 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  37.56 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  42.28 
 
 		 198 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 426 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 448 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  33.15 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 444 aa  97.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  34.64 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 439 aa  93.6  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  37.43 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 416 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.71 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 423 aa  90.5  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 439 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>