More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1938 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  879    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 440 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 472 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 506 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 405 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 578 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 441 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.41 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  28.71 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.64 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  28.71 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 424 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.81 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 457 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  44.16 
 
 		 198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 416 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.83 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.4 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  29.54 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>