More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0918 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  846    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  55.94 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  48.82 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 472 aa  355  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  44.68 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  44.68 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  44.22 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 461 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  40 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 443 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 471 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 454 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  44.49 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 448 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  39.92 
 
 		 536 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 426 aa  156  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.89 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 578 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  33.94 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  35.79 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  41.61 
 
 		 198 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>