More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5303 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  100 
 
 		 457 aa  906    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  79.95 
 
 		 443 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  99.56 
 
 		 457 aa  904    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  40 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 437 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 461 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.8 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 506 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 536 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 459 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  33.85 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  34.94 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  35.64 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 578 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 533 aa  123  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>