More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3254 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
416 aa  838    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  75.88 
 
 
422 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  64.44 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  60.73 
 
 
420 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
413 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
422 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
405 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
850 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
420 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.83 
 
 
438 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.23 
 
 
472 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  24.8 
 
 
427 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
453 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  27.9 
 
 
451 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  25.57 
 
 
430 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  25.96 
 
 
405 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.87 
 
 
449 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
431 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
413 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.2 
 
 
405 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.41 
 
 
472 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.12 
 
 
446 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.28 
 
 
442 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.12 
 
 
446 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
426 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.39 
 
 
427 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  26.51 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.28 
 
 
578 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  24.8 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.39 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.85 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.37 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  23.58 
 
 
440 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  33.68 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  25.86 
 
 
506 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  24.91 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.56 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  24.88 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  28.86 
 
 
457 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  27.76 
 
 
457 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.6 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.84 
 
 
542 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
442 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.47 
 
 
436 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.52 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.17 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
442 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.84 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
453 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  24.88 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  24.88 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.93 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
440 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.06 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.85 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
427 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
427 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  23.75 
 
 
440 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.3 
 
 
469 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.94 
 
 
429 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25 
 
 
453 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.48 
 
 
423 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.48 
 
 
423 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.3 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  24.74 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  25.4 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.38 
 
 
464 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.06 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.79 
 
 
443 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.82 
 
 
463 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.78 
 
 
417 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  26.84 
 
 
441 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.01 
 
 
433 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  26.82 
 
 
463 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  26.82 
 
 
463 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  23.42 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.09 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26.81 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.64 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.76 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.19 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  24.73 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  25.34 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.91 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>