More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43382 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43382  predicted protein  100 
 
 		 555 aa  1126    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 850 aa  92.8  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  26 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 440 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  27.18 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.97 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.51 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  25 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  25.3 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.22 
 
 		 436 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  25.08 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.9 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.67 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  24.17 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.27 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.29 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  23.87 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  30.37 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  23.87 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  23.87 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.94 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.4 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  24.81 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  24.55 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.39 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  25.39 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.39 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.39 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.39 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>