186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42838 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42838  MFS family transporter  100 
 
 
472 aa  929    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183784  normal  0.513972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
413 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
413 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
426 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
426 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.43 
 
 
426 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.23 
 
 
413 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.36 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.93 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  24.48 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.05 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.15 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.85 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.12 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.77 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.77 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.77 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.3 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.58 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.15 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.64 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.57 
 
 
450 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.89 
 
 
405 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  24.46 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  23.93 
 
 
439 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  28.57 
 
 
440 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.35 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  38.89 
 
 
518 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.31 
 
 
465 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  29.31 
 
 
465 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  25.55 
 
 
438 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  21.81 
 
 
386 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  33.01 
 
 
399 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  22.71 
 
 
447 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  33.08 
 
 
443 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.19 
 
 
480 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  29.32 
 
 
391 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  25.5 
 
 
452 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.58 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  25.11 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 
472 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  24.2 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 
489 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
427 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 
530 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 
565 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
427 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.19 
 
 
520 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01450  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 
509 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 
529 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
391 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  26.97 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 
587 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  21.79 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.37 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.29 
 
 
582 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  36.17 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
385 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  23.17 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34.29 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08340  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 
503 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135417  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  36.9 
 
 
626 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.53 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  29.36 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  38.89 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  24.37 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  28.23 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  25 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 
522 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 
545 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.97 
 
 
508 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
410 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.46 
 
 
532 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  28.81 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 
399 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.94 
 
 
496 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 
515 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  32.63 
 
 
461 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 
527 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  27.14 
 
 
428 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>