More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2179 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  88 
 
 
582 aa  851    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
587 aa  1129    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  86.96 
 
 
553 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  74.07 
 
 
519 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  75.64 
 
 
518 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  75.57 
 
 
523 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  65.35 
 
 
521 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  70.09 
 
 
532 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  91.62 
 
 
334 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  91.62 
 
 
334 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  91.62 
 
 
334 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  56.59 
 
 
514 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.87 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  47.28 
 
 
510 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 
511 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  79.8 
 
 
243 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  81.28 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
574 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 
469 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 
522 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  36.23 
 
 
519 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 
516 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.73 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.82 
 
 
528 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 
527 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
522 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
478 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.54 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
505 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.07 
 
 
529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.87 
 
 
512 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  36.72 
 
 
506 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.63 
 
 
512 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  32.94 
 
 
512 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.63 
 
 
512 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.91 
 
 
512 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.56 
 
 
512 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.56 
 
 
512 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.82 
 
 
521 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 
489 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 
522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 
508 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.14 
 
 
519 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.13 
 
 
500 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  34 
 
 
513 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.94 
 
 
463 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
502 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
485 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.35 
 
 
509 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 
520 aa  189  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 
532 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 
504 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
452 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
478 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 
489 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 
468 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 
484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.56 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
507 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 
511 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 
490 aa  183  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 
480 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
463 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
458 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
483 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
520 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 
519 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 
487 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 
527 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 
487 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  37.38 
 
 
538 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 
531 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 
490 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
498 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 
522 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.12 
 
 
492 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  34.13 
 
 
518 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  38.08 
 
 
530 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
515 aa  177  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
477 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  30.1 
 
 
520 aa  176  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 
510 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  37.01 
 
 
535 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.05 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.35 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.55 
 
 
468 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  33.03 
 
 
523 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 
458 aa  173  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
528 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>