More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1603 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  762    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1794  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  39.15 
 
 		 395 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  39.15 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0076  arabinose efflux permease  36.94 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 417 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.790878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1251  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.13 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.4 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.05 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 415 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.52 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.15 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  30.75 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.32 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  32.97 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.61 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.44 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.16 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  29.27 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 317 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  32 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  29.25 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  34.52 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  27.5 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>