More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1929 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  89.26 
 
 
394 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  785    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  36.41 
 
 
390 aa  250  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2068  multidrug resistance protein B  88.5 
 
 
130 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.45456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
397 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  24.51 
 
 
407 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  27.06 
 
 
402 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
404 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  28.62 
 
 
384 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
428 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  27.22 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  28.11 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  27.22 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  27.22 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  26.98 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  26.33 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  28.48 
 
 
418 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  26.04 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  23.95 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  25.07 
 
 
400 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  26.41 
 
 
424 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6453  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
410 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  24.28 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  25.51 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  24.63 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
424 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  24.11 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  25.83 
 
 
400 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  25.28 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  25.37 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  22.73 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  25.22 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
410 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
422 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
417 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
438 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
438 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.03 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  25.66 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.03 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.03 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  28.1 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  24.63 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  25.52 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  27.24 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  24.29 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.06 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  24.63 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  25.56 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  26.22 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  25.86 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  24.71 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  25.42 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  25.71 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  25.6 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  26.96 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  23.61 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.66 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  25.71 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  25.86 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  25.51 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.8 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  25.89 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.65 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  25.4 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.65 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  25.17 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  25.26 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  24.66 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>