More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6453 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6453  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  776    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  22.42 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.07 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.42 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 481 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  30 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.97 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  30.54 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  32.31 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 584 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  35.53 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  31.17 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29.53 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  28.21 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  31.9 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  25.51 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.99 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  31.9 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  28.23 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  30.19 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  25.18 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.53 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.5 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.98 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.57 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>