More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  100 
 
 		 493 aa  922    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1953  major facilitator superfamily MFS_1  68.35 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3341  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 519 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 525 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 541 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  31.79 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 555 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  31.74 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 485 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 516 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  30.05 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.03 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 513 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 506 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 517 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  30.81 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  28 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.35 
 
 		 537 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 524 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 493 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 511 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.37 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 588 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 509 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 523 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 		 522 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.75 
 
 		 477 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  28.7 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>