More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1514 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 393 aa  745    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.93 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  28.35 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  26.93 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  26.44 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  26.44 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  26.44 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  26.44 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  26.05 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  27.78 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  26.82 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  24.41 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  23.3 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  32.76 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  31.17 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  28.49 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  28.73 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1794  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1726  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0692378  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  30.47 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  30.59 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 408 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.51 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  27.57 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  32.36 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.21 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 476 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  27 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  29.59 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  23.28 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4004  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  30.74 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  38.04 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.72 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  25.22 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  30.74 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01240  arabinose efflux permease family protein  26.94 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  30.28 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>