More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3198 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  100 
 
 		 329 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  98.77 
 
 		 394 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  99.08 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  99.08 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  99.08 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  98.77 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  98.16 
 
 		 394 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  88.34 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  92.33 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  92.02 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  91.72 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  92.02 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  92.02 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  78.16 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  78.16 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  77.85 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  74.37 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  71.3 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  76.9 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  71.84 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  71.03 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  98.67 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  59.36 
 
 		 413 aa  298  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  62.97 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  62.66 
 
 		 395 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 		 411 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  62.66 
 
 		 395 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 426 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  62.97 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 399 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  43.93 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 423 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 399 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 401 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 416 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 398 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 399 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.18 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.18 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.18 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.18 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.18 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.8 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.18 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 415 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.08 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.08 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 419 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 391 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 400 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 408 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 411 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  44.58 
 
 		 414 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  45.06 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.68 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50.31 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.270736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 410 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 398 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>