More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1520 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  96.85 
 
 		 381 aa  735    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  818    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  73.25 
 
 		 402 aa  594  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  51.96 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  36.44 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  36.46 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  33.92 
 
 		 452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 424 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  27.97 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  27.97 
 
 		 410 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  27.97 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  27.97 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  28.07 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  25.94 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  28.08 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  29.06 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  29.06 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  27.85 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  27.85 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  27.85 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  26.14 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  27.93 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  29.03 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  27.89 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>