More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8091 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  56.43 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6878  hypothetical protein  98.47 
 
 		 233 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  28.69 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  34.21 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  31.72 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  28.01 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  31.79 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 499 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  27.79 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  28.53 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  32.98 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  28.61 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  26.99 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  30.53 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  27.2 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  28.65 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0770  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>