276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2900 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  100 
 
 
397 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
452 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  100 
 
 
397 aa  769    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  100 
 
 
397 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  99.5 
 
 
452 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  99.75 
 
 
397 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  100 
 
 
397 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  51.39 
 
 
398 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  50.88 
 
 
398 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  50.88 
 
 
398 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  53.11 
 
 
425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  50.7 
 
 
397 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  35.13 
 
 
412 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  34.64 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  31.79 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  33.42 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
414 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  39.3 
 
 
384 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  33.43 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  35.96 
 
 
384 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  33.61 
 
 
387 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
397 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
393 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
408 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
403 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
434 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
387 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
410 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  33.61 
 
 
400 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
363 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  27.32 
 
 
405 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
393 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  27.49 
 
 
417 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  27.65 
 
 
421 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
417 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  28.9 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  27.95 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  24.15 
 
 
427 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  26.11 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  29.48 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  30.31 
 
 
526 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  27.65 
 
 
416 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  28.24 
 
 
393 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
408 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
438 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
438 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
429 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
429 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
429 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
429 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
481 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
428 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
537 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  27.55 
 
 
414 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
407 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  27.55 
 
 
426 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  24.5 
 
 
409 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
425 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
422 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  26.98 
 
 
414 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  28.61 
 
 
406 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
377 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  25.13 
 
 
411 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.45 
 
 
414 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  30.87 
 
 
402 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1683  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  28.45 
 
 
433 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  28.65 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  25.61 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  25.61 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  27.04 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  25.61 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  27.04 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
422 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0834  major facilitator transporter  24.78 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
434 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  26.18 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  24.94 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  24.02 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  25.07 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>