More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1469 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 377 aa  724    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0747  major facilitator transporter  68.7 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  60.11 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0581  putative transport protein  38.34 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0834  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1683  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0770  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2537  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128789  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 499 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  30.69 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 405 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  29.55 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  29.77 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  24.93 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  27.7 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  27.7 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  27.7 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  27.32 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  27.32 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  27.38 
 
 		 433 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  24.86 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  23.48 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 434 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 437 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  24.29 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  26.72 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  25.56 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  23.26 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  24.79 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  25.72 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 526 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>