More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68930  putative permease  100 
 
 		 397 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 425 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  50 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  50 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  50 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  50 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  50 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  50 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  49.73 
 
 		 452 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  36.76 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  38.07 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 387 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 416 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  30.25 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 363 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  29.19 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  27.34 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  32.58 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 481 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  27.34 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  29.25 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  27.34 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  32.68 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0834  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 537 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  27.09 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  30.29 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  30.29 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>