More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2342 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 393 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  43.22 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  36.24 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  43.01 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 397 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  35.75 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  36 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 537 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 441 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 441 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 434 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  32.5 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  33.93 
 
 		 433 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  37.03 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0770  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 429 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 499 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  35.64 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  29.92 
 
 		 424 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  28.57 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>