More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0303 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  799    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  73.25 
 
 		 412 aa  594  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  75.59 
 
 		 381 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  37.68 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  34.92 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  29.24 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  28.42 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  27.7 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  30.83 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  27.7 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  27.7 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  30.56 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  27.7 
 
 		 410 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  26.92 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  30.94 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  30.94 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  30.94 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 526 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  28.28 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  29.56 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  25.7 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  30.12 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>