235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1359 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  60.74 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  30.77 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  39.12 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  33.97 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6878  hypothetical protein  63.64 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  27.2 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  27.2 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  27.2 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  27.13 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  29.62 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  25.89 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 417 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.4 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  28.11 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  27.76 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  28.04 
 
 		 438 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  26.12 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  27.02 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  26.43 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  26.43 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  25.75 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  26.43 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  26.43 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  26.43 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  31.11 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  27.22 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>