92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6878 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6878  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  98.47 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  63.64 
 
 		 400 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  60.38 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  33.91 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 467 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 393 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 412 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 467 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 457 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  35 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  32.32 
 
 		 478 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 463 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  29.2 
 
 		 381 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 467 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 479 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 411 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  36 
 
 		 474 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 405 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 487 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 499 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4303  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 468 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 456 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 398 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 514 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 467 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 		 527 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  31.15 
 
 		 523 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 467 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 411 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 467 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 492 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  30 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 467 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 411 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 411 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 411 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  34.04 
 
 		 461 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  30 
 
 		 437 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1617  major facilitator family transporter  30.94 
 
 		 405 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 465 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.77 
 
 		 415 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 422 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 454 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  30.53 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 410 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 414 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  29.93 
 
 		 451 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  32.95 
 
 		 542 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 414 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 424 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 424 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  20.11 
 
 		 399 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.32 
 
 		 462 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 433 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  27.59 
 
 		 443 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 450 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5957  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0570513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 434 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 398 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 433 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 488 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 408 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 455 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  21.61 
 
 		 432 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 458 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  25.29 
 
 		 485 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 458 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  31.82 
 
 		 547 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  39.78 
 
 		 457 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.07 
 
 		 461 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 451 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 425 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 433 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 524 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  21.18 
 
 		 399 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 432 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>