More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4303 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4303  major facilitator transporter  100 
 
 		 468 aa  926    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0162  major facilitator transporter  66.45 
 
 		 467 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 456 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 445 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  29.67 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 447 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  31.84 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  29.73 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  30.65 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  30.65 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  30.65 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  30.13 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  31.58 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  29.87 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.41 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.41 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.41 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.41 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  31.33 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  29.22 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 443 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.15 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.37 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.86 
 
 		 461 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  30.13 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  29.1 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  29.62 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  29.62 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  30.41 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  30.13 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  29.87 
 
 		 433 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  29.87 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  29.21 
 
 		 475 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.59 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.19 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  28.82 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 450 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 447 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.26 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.67 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  31.87 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  28.32 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.64 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  28.57 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  29.68 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  31.29 
 
 		 452 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  27.34 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>