More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0162 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0162  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4303  major facilitator transporter  66.45 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 451 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  31.03 
 
 		 446 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  30.71 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  30.47 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  31.83 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  30.54 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  29.98 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  29.98 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  29.73 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  28.05 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  29.98 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  29.98 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  29.48 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  29.92 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32.12 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.36 
 
 		 454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.25 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.25 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.25 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.25 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.25 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.25 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  30.25 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  27.03 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.15 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.22 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  28.22 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  28.21 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.57 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  29 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  25.23 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  30.14 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.24 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  29.15 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 438 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.89 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.15 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  31.45 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  28.04 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.34 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  30.75 
 
 		 579 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>