More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3830 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  99.51 
 
 
411 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  93.18 
 
 
398 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  89.06 
 
 
411 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  87.1 
 
 
411 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  87.56 
 
 
409 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 
422 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  62.02 
 
 
428 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  61.69 
 
 
411 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  58.76 
 
 
403 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  48.89 
 
 
426 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  62.72 
 
 
443 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  63.19 
 
 
406 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  63.45 
 
 
406 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  49.38 
 
 
410 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  59.09 
 
 
352 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  50.76 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  50.53 
 
 
401 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  49.49 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  50 
 
 
401 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  49.21 
 
 
401 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 
404 aa  315  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  46.72 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  50.27 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 
405 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  52.39 
 
 
408 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  44.56 
 
 
402 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  60.79 
 
 
403 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  53.48 
 
 
393 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  47.62 
 
 
419 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  59.52 
 
 
400 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  51.46 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.24 
 
 
399 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.22 
 
 
399 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.97 
 
 
399 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.02 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.71 
 
 
399 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  43.53 
 
 
404 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.02 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.02 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.02 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.02 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.76 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.68 
 
 
394 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.42 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.53 
 
 
399 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.53 
 
 
399 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 
406 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
409 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.28 
 
 
394 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 
399 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.48 
 
 
394 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
399 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.58 
 
 
394 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.47 
 
 
411 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.15 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.32 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.49 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  40.21 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.49 
 
 
405 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.49 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.49 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.81 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.49 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.49 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.49 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 
423 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  41.27 
 
 
329 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.4 
 
 
403 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 
394 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.47 
 
 
399 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.56 
 
 
398 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.5 
 
 
389 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.5 
 
 
389 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  38.52 
 
 
398 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.19 
 
 
400 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.6 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  37.53 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.14 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  39.17 
 
 
415 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  37.85 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.08 
 
 
421 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
397 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
413 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.43 
 
 
395 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
413 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  38.79 
 
 
401 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.92 
 
 
395 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  57.78 
 
 
230 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  57.78 
 
 
230 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  36.55 
 
 
405 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  39.79 
 
 
398 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.79 
 
 
429 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  39.79 
 
 
398 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>