More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2776 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  803    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  75.95 
 
 
399 aa  626  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  51.67 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  51.67 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
404 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  53.33 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  52.56 
 
 
404 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  51.93 
 
 
404 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  43.86 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.32 
 
 
416 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
397 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  41.79 
 
 
411 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  42.61 
 
 
406 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 
397 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
413 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  43.12 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  41.67 
 
 
410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
397 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  40.9 
 
 
411 aa  313  4.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  41.03 
 
 
408 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  40.77 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  40.77 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  40.77 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  40.77 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  43.23 
 
 
418 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  42.55 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  40.66 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  41.19 
 
 
487 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
403 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
403 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  40.72 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  42.26 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  40.31 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  42.13 
 
 
404 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  41.88 
 
 
404 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  41.88 
 
 
404 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  41.62 
 
 
404 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  41.62 
 
 
404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
400 aa  292  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  40.7 
 
 
394 aa  292  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  40.42 
 
 
398 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  40.15 
 
 
405 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  40.7 
 
 
394 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  40.77 
 
 
407 aa  286  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  39.79 
 
 
404 aa  280  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  39.13 
 
 
409 aa  277  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  43.22 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  41.01 
 
 
403 aa  273  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
395 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
406 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
410 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  35.94 
 
 
389 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  33.51 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  34.01 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.17 
 
 
401 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
404 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  30.84 
 
 
450 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  29.9 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  29.9 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
411 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.81 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.68 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
414 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  24.85 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.6 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25.93 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
414 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
423 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.13 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  25.47 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.6 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.6 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.98 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.91 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.21 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  27.18 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.6 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.2 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.6 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30.36 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>