More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6693 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  790    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 410 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  28.69 
 
 		 398 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  28.92 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.49 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  27.49 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  24.93 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  24.29 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  23.01 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.15 
 
 		 504 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06942  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  23.99 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  25.91 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  25.93 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  25.91 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  25.42 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  22.74 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  25.86 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  24.03 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  26.57 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  26.32 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  26.32 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.49 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.37 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.38 
 
 		 505 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02613  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00230)  33.91 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  30.11 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.55 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.55 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.55 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.55 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  20.32 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.14 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.4 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  26.4 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.71 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  25.09 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  23.68 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.66 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>