More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2633 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 386 aa  725    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  59.04 
 
 		 417 aa  352  5e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 372 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  42.77 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  41.57 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  40.75 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 408 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.59 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.59 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.59 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.96 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.59 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.11 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  27.52 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 414 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.49 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.49 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.56 
 
 		 388 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.49 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.23 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.23 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.01 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.87 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  28.42 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 415 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  32.43 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>