More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2328 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  70.84 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  46.6 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 398 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  30 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  32 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  27.91 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  21.45 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.35 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.35 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.51 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  21.49 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.2 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  26.49 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  23.36 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  27.55 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  23.88 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  23.98 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.16 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4380  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000603608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4574  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4718  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4221  tetracycline resistence protein, metal-tetracycline/H+ antiporter  26.54 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  27.51 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.12 
 
 		 493 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 505 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.77 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.11 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  26.8 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  26.8 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.57 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.38 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29843  dityrosine transporter A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  27.22 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.323867  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.7 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  24.33 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.38 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>