More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29843 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29843  dityrosine transporter A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  100 
 
 
469 aa  944    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.323867  normal  0.166066 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02707  conserved hypothetical protein  45.7 
 
 
478 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03580  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 
633 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0622174  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07936  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01520)  28.72 
 
 
504 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05656  MFS multidrug resistance transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13660)  28.26 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.481984 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07070  dityrosine transporter, putative  27.02 
 
 
640 aa  173  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05628  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11060)  27.96 
 
 
592 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.578894  normal  0.0253476 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  26.56 
 
 
549 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06774  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11760)  27.37 
 
 
457 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0399317  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10920  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
571 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.047229  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87327  multidrug resistance transporter  25 
 
 
554 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
521 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10958  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05350)  26.86 
 
 
502 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33820  multidrug resistance transporter  25.43 
 
 
476 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0731367 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04840  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06942  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60920  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance multidrug resistance transporter  36.51 
 
 
569 aa  126  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00174903  normal  0.758845 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00739  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16320)  26.54 
 
 
486 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06477  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01930)  25.86 
 
 
543 aa  123  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0082392 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05220  membrane transport protein, putative  27.13 
 
 
595 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00270  multiple drug resistance protein, putative  25.71 
 
 
642 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06019  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00615305 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00290  multiple drug resistance protein, putative  25.82 
 
 
636 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07972  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0939486 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11120  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03040)  24.62 
 
 
608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0161613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60062  spermidine exporter, MDR-type pump  26.05 
 
 
577 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105172  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01330  polyamine transport-related protein, putative  23.12 
 
 
556 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02675  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01120)  23.01 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00732  Putative multidrug resistance proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5DQ91]  24.67 
 
 
592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911456  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03270  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01890)  25.62 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314909 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84561  Synaptic vesicle transporter SVOP  25.85 
 
 
604 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85553  Putative transporter  23.79 
 
 
601 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00540  hypothetical protein  25.24 
 
 
535 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08083  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01350)  24.58 
 
 
560 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02613  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00230)  22.75 
 
 
506 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774047 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50953  Polyamine transport protein (TPO4)  25.12 
 
 
488 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00584761  normal  0.988628 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00100  multidrug transporter, putative  25.06 
 
 
653 aa  100  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  22.91 
 
 
532 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08610  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 
456 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08089  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 
525 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0159266  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53777  Putative transporter C530  24.63 
 
 
659 aa  99.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00332  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 
523 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00030  multidrug transporter, putative  24.37 
 
 
468 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.678764  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07295  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16860)  25.3 
 
 
544 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.30321  normal  0.0432788 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  24.82 
 
 
752 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10951  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
502 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.566626  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01860  SCR1 protein, putative  22.04 
 
 
513 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04313  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06050)  23.52 
 
 
578 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160209  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58217  multidrug resistance protein 2  23.34 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0156255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  33 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  33 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46042  multidrug resistance protein 10  22.45 
 
 
510 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.25 
 
 
390 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47451  multidrug resistance protein 4  26.12 
 
 
581 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000199475  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10152  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04900)  24.79 
 
 
479 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43743  multidrug resistance protein 3  24.46 
 
 
592 aa  90.5  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500194  normal  0.0710927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  26.03 
 
 
393 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02210  spermine transporter, putative  22.12 
 
 
528 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00970  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79030]  22.78 
 
 
475 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63750  multidrug resistance protein 6 benomyl/methotrexate resistance protein  22.25 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.439145  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53101  multidrug resistance protein 7  23.85 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06063  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08910)  24.09 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05329  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  27.65 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01450  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06451  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  28.09 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.83 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08621  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02780)  25.52 
 
 
542 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  32 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59685  multidrug resistance  22.31 
 
 
537 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  33.78 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01250  conserved hypothetical protein  21.1 
 
 
515 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  31.5 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03985  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00420)  23.89 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04241  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06440)  25.26 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.719625 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00390  multidrug transporter, putative  22.59 
 
 
563 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177552  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08993  conserved hypothetical protein  24.01 
 
 
903 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574507  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.99 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08911  conserved hypothetical protein  20.95 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00489  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13830)  24.34 
 
 
552 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00547  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.57711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.51 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.48 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.98 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.17 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.91 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04119  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04910  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
526 aa  76.6  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.413844  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06928  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01691  conserved hypothetical protein  21.78 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.02998  normal  0.0975408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  23.12 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.18 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  24.35 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01243  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10370)  22.44 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.06 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>