More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1819 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  100 
 
 		 417 aa  800    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  56.3 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 372 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  40.52 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  39.32 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.51 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.99 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.36 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.07 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.79 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.59 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.59 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  30.95 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  32.86 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  32.15 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  31.77 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  25.35 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  32.7 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  33.5 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>