More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3885 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 382 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  83.29 
 
 		 372 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  72.24 
 
 		 372 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  70.19 
 
 		 391 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  39.63 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  37 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.77 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.66 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  34.52 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  33.8 
 
 		 416 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  32.11 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.14 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  33.96 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.67 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.8 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.8 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  32.09 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.52 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.8 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  25.98 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.8 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0485  putative transporter  25.98 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  33.89 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.51 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  25.46 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.38 
 
 		 397 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  31.58 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  31.59 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  33.21 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.11 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  33.21 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 407 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  34.36 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>