More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0485 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  97.24 
 
 
399 aa  773    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  97.24 
 
 
399 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0485  putative transporter  100 
 
 
399 aa  791    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  38.18 
 
 
400 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  39.61 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
404 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  36.51 
 
 
391 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  36.24 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  35.97 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  37.98 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  35.69 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  35.7 
 
 
400 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  38.99 
 
 
403 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  37.57 
 
 
400 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  37.2 
 
 
401 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
404 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  36.55 
 
 
404 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
404 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
404 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  36.11 
 
 
404 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
404 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  35.19 
 
 
397 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.23 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.25 
 
 
400 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.25 
 
 
400 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  33.33 
 
 
400 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  34.16 
 
 
400 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  36.19 
 
 
415 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  35.96 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  36.19 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  33.52 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  36.19 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  36.19 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.32 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  33.24 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  36.61 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  36.16 
 
 
394 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  35.07 
 
 
398 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  35.75 
 
 
404 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  36.29 
 
 
404 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
317 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.71 
 
 
392 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.42 
 
 
405 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  30.21 
 
 
397 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  35.67 
 
 
406 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
388 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.49 
 
 
388 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
392 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  34.35 
 
 
407 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.56 
 
 
388 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.45 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  29.82 
 
 
395 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.05 
 
 
391 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  29.56 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  30.83 
 
 
393 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.87 
 
 
390 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  33.91 
 
 
391 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
390 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.87 
 
 
390 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.39 
 
 
390 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
406 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  32.66 
 
 
393 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
407 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.94 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.07 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
403 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
397 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.01 
 
 
388 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  31.04 
 
 
388 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
393 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  30.64 
 
 
388 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  30.61 
 
 
392 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.25 
 
 
408 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  31.71 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  32.46 
 
 
386 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  32.46 
 
 
386 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  32.46 
 
 
386 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  28.98 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  31.43 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
388 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  29.44 
 
 
400 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  29.56 
 
 
404 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  31.84 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  31.49 
 
 
389 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.59 
 
 
387 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.28 
 
 
391 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>