More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2170 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  100 
 
 		 372 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  83.29 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  73.05 
 
 		 372 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  65.43 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  40.18 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  36.63 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.79 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.91 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  35.65 
 
 		 425 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  33.62 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.41 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  31.62 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 391 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.92 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  31.4 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 397 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  31.23 
 
 		 400 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  34.02 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  31.81 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.47 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.69 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 394 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 409 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.17 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  29.07 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>