More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  100 
 
 
398 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  37.53 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  36.62 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  37.53 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  36.62 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  37.53 
 
 
390 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  37.14 
 
 
394 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  37 
 
 
390 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  37 
 
 
390 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  38.34 
 
 
390 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  36.36 
 
 
431 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  38.24 
 
 
421 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  33.33 
 
 
388 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.79 
 
 
396 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.63 
 
 
404 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.37 
 
 
404 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.37 
 
 
415 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.1 
 
 
415 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
404 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.37 
 
 
404 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
404 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 
397 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  33.59 
 
 
397 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.6 
 
 
391 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  34.28 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  37.12 
 
 
388 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.17 
 
 
400 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  35.71 
 
 
393 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.84 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  36.83 
 
 
409 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  35.6 
 
 
387 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.49 
 
 
394 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.58 
 
 
404 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  36.05 
 
 
387 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  36.05 
 
 
387 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.23 
 
 
391 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.95 
 
 
408 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.23 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.9 
 
 
391 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.51 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.51 
 
 
391 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4572  major facilitator transporter  36.22 
 
 
455 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
408 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.96 
 
 
391 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  31.56 
 
 
396 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.34 
 
 
391 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  36.49 
 
 
390 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  38.06 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  34.51 
 
 
394 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.34 
 
 
391 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.08 
 
 
400 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.08 
 
 
400 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.38 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  35.99 
 
 
425 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  32.22 
 
 
407 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.43 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  37.13 
 
 
391 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.79 
 
 
416 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  33.08 
 
 
400 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  36.26 
 
 
402 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.79 
 
 
391 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  32.17 
 
 
400 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.61 
 
 
391 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  36.11 
 
 
390 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  29.86 
 
 
387 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
403 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  32.59 
 
 
400 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  33.96 
 
 
407 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  32.71 
 
 
395 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  32.71 
 
 
395 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.09 
 
 
391 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  33.93 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  32.87 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  32.36 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  30.59 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  33.63 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  30.52 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  32.11 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  32.65 
 
 
400 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.95 
 
 
389 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  33.63 
 
 
407 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32.39 
 
 
400 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  33.07 
 
 
389 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  33.16 
 
 
389 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.01 
 
 
388 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  30.52 
 
 
396 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  33.79 
 
 
400 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>