More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2076 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  100 
 
 
393 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  87.02 
 
 
387 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  87.02 
 
 
387 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  87.02 
 
 
387 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4572  major facilitator transporter  82.61 
 
 
455 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  50.66 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  38.82 
 
 
390 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  38.68 
 
 
390 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  38.56 
 
 
390 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  38.56 
 
 
390 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  38.17 
 
 
390 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  38.42 
 
 
394 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  37.91 
 
 
414 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  37.91 
 
 
414 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  38.68 
 
 
390 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  38.87 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1820  MFS family transporter  48.26 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21300  putative MFS transporte  46.09 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  36.98 
 
 
421 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  29.97 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
404 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
403 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  36.04 
 
 
383 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 
391 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 
391 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 
391 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.32 
 
 
391 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.05 
 
 
391 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.83 
 
 
400 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.17 
 
 
391 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.92 
 
 
397 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  30.73 
 
 
400 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32.1 
 
 
400 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  33.75 
 
 
398 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  31.91 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.71 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  28.69 
 
 
398 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  31.7 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  31.7 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.94 
 
 
400 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  30.79 
 
 
401 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.32 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  31.79 
 
 
394 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
386 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  27.67 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  27.67 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  31.35 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  28.39 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  30.69 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.77 
 
 
400 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
404 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.48 
 
 
391 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.34 
 
 
404 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.83 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.97 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
415 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
404 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.85 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.39 
 
 
404 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.85 
 
 
391 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.08 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.08 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.08 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.08 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.08 
 
 
404 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.59 
 
 
391 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.58 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.89 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  30.79 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.33 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.61 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.66 
 
 
388 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.08 
 
 
414 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
394 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  27.54 
 
 
392 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
385 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  30.28 
 
 
407 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  29.57 
 
 
388 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
397 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26710  arabinose efflux permease family protein  33.63 
 
 
399 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29.72 
 
 
391 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  29.43 
 
 
391 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  33.59 
 
 
416 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.85 
 
 
409 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  32.11 
 
 
390 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7916  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
383 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  28.49 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  28.79 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  30.54 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  29.18 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.87 
 
 
396 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
391 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>