More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7916 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7916  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 383 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  30.93 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  30.7 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  31.39 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  31.07 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 409 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  33.57 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.86 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  33.24 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  29.94 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  30.42 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.4 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.17 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.17 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.93 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4572  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.93 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.32 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.32 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>